中國人群中先天性甲狀腺功能減低癥、慢性胰腺炎、遺傳性掌跖角化癥等疾病的致病基因變異攜帶者較歐美人群顯著更多，具地域分布特征
北方人比南方人酒量相對更好，藏族、蒙古族、彝族人群和河南人酒量居于全國前列，但山東人酒量并不突出，福建人和廣東人排在最后
4月30日，中國代謝解析計劃(ChinaMAP)聯(lián)盟攜全國29家研究機構(gòu)和醫(yī)院，在中科院上海生命科學(xué)研究院主辦的《細胞探索》雜志發(fā)表研究結(jié)果，首次報道ChinaMAP一期研究對覆蓋全國27個省份和直轄市，8個民族，超過1萬人的高深度全基因組測序數(shù)據(jù)和表型的系統(tǒng)性分析。上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院、國家代謝性疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心王衛(wèi)慶教授和畢宇芳是論文的共同通訊作者，曹亞南、李林和徐敏研究員等為共同第一作者。此次發(fā)表意味著，通過中國人自己的儀器、平臺、分析方法，對中國人的基因組特征進行研究，具有前所未有的本土意義。
具有特有變異位點
王衛(wèi)慶介紹，研究團隊對隊列中代表中國不同地區(qū)和民族的10588人的DNA樣本，使用華大基因華大智造的國產(chǎn)自主高通量測序平臺進行40×深度全基因組測序，完成了高質(zhì)量的中國人群遺傳變異數(shù)據(jù)構(gòu)建、中國人群體結(jié)構(gòu)分析、基因組特征比較以及變異頻譜和致病性變異解析。在ChinaMAP一期數(shù)據(jù)庫中，包含1.36億個基因多態(tài)性位點SNP和1000萬個插入或缺失位點(NDEL)，其中一半是在國際通用的多個數(shù)據(jù)庫中均沒有的新位點。
那么，中國人群是否具有特有的遺傳性疾病相關(guān)變異位點?曹亞南介紹，中國人群中先天性甲狀腺功能減低癥、慢性胰腺炎、遺傳性掌跖角化癥等疾病的致病基因變異攜帶者較歐美人群顯著更多，且具有地域分布特征，“如與甲狀腺功能減退發(fā)生相關(guān)的一些致病變異頻率在中國人群中比歐美人群高10倍以上。”在營養(yǎng)代謝和藥物代謝相關(guān)遺傳特征上，ChinaMAP一期研究對受到大眾廣泛關(guān)注的酒精代謝能力也做了研究——總體而言，北方人比南方人酒量相對更好，藏族、蒙古族、彝族人群和河南人酒量居于全國前列，但山東人酒量并不突出，福建人和廣東人排在最后。研究證實，導(dǎo)致喝酒臉紅和酒精代謝能力差的乙醛脫氫酶2基因rs671變異是東亞人特異性的，在中國人群中的攜帶者遠高于全球其他人群，“rs671變異也是誘發(fā)食管癌發(fā)生的重要風(fēng)險因素，喝酒臉紅還是應(yīng)少喝酒。”
建高質(zhì)量中國人群數(shù)據(jù)庫
研究團隊也對抗凝藥華法林的減量使用、抗血小板藥物氯吡格雷的適用人群分類、他汀類降脂藥副作用風(fēng)險人群進行分析。“如高脂血癥患者常用的降脂藥辛伐他汀，中國人中有超過20%的個體存在橫紋肌溶解這一不良反應(yīng)的風(fēng)險。”
而對于代謝性疾病，特別是2型糖尿病和肥胖，在全球的精準評估治療中也因基因變異和遺傳因素非常不同。“如歐洲人群中最顯著的2型糖尿病遺傳風(fēng)險TCF7L2基因變異(如rs7903146)在中國人中的頻率很低，并不重要，在代謝特征和疾病研究中僅參考和驗證歐美人群的結(jié)果是不行的。”此次研究者以量化評分、年齡和血糖值的排序三維顯示了每個人在整個群體中的精確位置，多基因風(fēng)險評分排名顯示2型糖尿病高風(fēng)險和低風(fēng)險的個體間存在非常顯著的血糖差異，高風(fēng)險個體隨著年齡增加，空腹和餐后2小時血糖都顯著高于中風(fēng)險和低風(fēng)險者。
此次研究以覆蓋中國各地區(qū)的研究隊列為基礎(chǔ)，建立了高質(zhì)量中國人群數(shù)據(jù)庫，未來可為疾病機制研究、預(yù)防、遺傳咨詢和公共衛(wèi)生管理提供依據(jù)。據(jù)悉，今年2月下旬，ChinaMAP報道的新冠病毒受體ACE2相關(guān)變異在全球不同人群中的比較分析成果在《細胞發(fā)現(xiàn)》發(fā)表，已被訪問下載超過20萬次。ChinaMAP對漢族和少數(shù)民族群體的精確遺傳結(jié)構(gòu)分析，也為中國人群的精準基因組學(xué)研究提供了參考數(shù)據(jù)。(記者 黃楊子)
