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中國科學(xué)家利用古DNA技術(shù)揭開南北方人群遷徙與混合之歷史

中國青年報 | 2020-05-19 08:51:13

科研人員進行古代人類樣本采集。中國科學(xué)院古脊椎動物與古人類研究所供圖

福建奇和洞約8400年前的2號個體頭骨。

付巧妹在古DNA超凈室工作。

中國山東一具約9500年前個體的顳骨。

我們是誰,我們從何而來?這些人類苦苦追尋的起源問題,如今有了一種最新認(rèn)識。

5月15日,國際學(xué)術(shù)期刊《科學(xué)》在線發(fā)表一項關(guān)于華夏族群探源的突破性研究成果,該研究由中國科學(xué)院古脊椎動物與古人類研究所研究員付巧妹團隊主導(dǎo),利用古DNA技術(shù)開啟了一趟尋根之旅,歷經(jīng)8年艱辛探索,逐步揭開東亞尤其是中國史前人群南北格局、遷徙擴散及遺傳混合的“神秘面紗”。

中國南北方人群究竟從哪里來,經(jīng)歷了怎樣的發(fā)展變遷,這一發(fā)現(xiàn)對人類演化史的研究又有什么意義?記者采訪了付巧妹團隊。

打開古代生命奧秘的鑰匙

近年來,與東亞毗鄰的東南亞、西伯利亞等地的古代人類遺傳演化研究已取得很多成果,但迄今為止,東亞尤其是中國南北方,史前人類基因組的相關(guān)信息卻所知甚少。

這時,古DNA技術(shù)登場了。

所謂古DNA技術(shù),就是通過現(xiàn)代分子生物學(xué)的手段,提取和分析保存在古代人類和動植物遺骸中的古DNA分子,用來研究人類起源與遷徙路線、人類遺骸的性別鑒定等內(nèi)容,解決了許多傳統(tǒng)手段無法解決的科學(xué)問題,被譽為打開古代生命奧秘的鑰匙。

不過,這把鑰匙并非誰都能用好,付巧妹說,運用古DNA技術(shù)需要非常謹(jǐn)慎地判斷和細(xì)致地操作,原因在于古DNA極易被污染。

事實上,這項研究工作自2012年起就已籌備開展,在2014年,付巧妹和團隊成員便成功獲得北方山東和南方島嶼亮島的幾個關(guān)鍵樣本基因組數(shù)據(jù),在東亞南北方古人群遺傳特點上,也得出了“非常有價值”的研究進展。

然而,其中一個細(xì)節(jié)卻始終讓付巧妹存疑,那就是“亮島作為島嶼的特殊地理位置”。她說,“亮島個體能否代表典型南方人群,他們與南方大陸人群會否存在巨大差異?”

于是,付巧妹帶領(lǐng)團隊,開始了長達6年的南方大陸樣品“攻堅戰(zhàn)”。

“我國南方大陸炎熱潮濕的氣候?qū)е履戏降臉颖静牧喜粌H稀少,而且微生物DNA污染嚴(yán)重,人類DNA被高度甚至完全降解。”付巧妹說,原本要從年代久遠(yuǎn)的人類骨骼遺骸中提取到內(nèi)源DNA已是不易,而南方樣本更是讓相關(guān)實驗和研究難上加難。

在之后近4年里,他們專注于南方樣本的采集和古DNA實驗。

其間,科研團隊還和我國南方多家博物館及考古機構(gòu)聯(lián)絡(luò)深度合作,也曾因古DNA樣品難獲得而吃“閉門羹”;他們深入南方30多個遺址,采集了257例古代人類樣本,卻常常遇到“樣本完全不含古DNA”,或是“保存條件太差而無法提取”的情況。

他們在古DNA技術(shù)方面不斷摸索,最終取得突破,能夠從大量土壤微生物DNA里“釣取”極其微量的人類內(nèi)源DNA,可成功捕獲僅占0.03%的人類核DNA。

“我們參與的古DNA短片段提取技術(shù),將非冰凍層人類古DNA破譯的時間推進到40萬年前。”付巧妹說,這些技術(shù)極大擴展了可用于古DNA研究的樣本范圍。

9500年前就有南北方人之分了

有了古DNA技術(shù)這把鑰匙,付巧妹團隊聯(lián)合多家科研機構(gòu),成功捕獲并測序了我國北方山東、內(nèi)蒙古及南方福建、毗鄰亮島和鎖港等地11個遺址的個體基因組。

“這些古老的證據(jù),為大時空框架下研究東亞古人群,尤其是現(xiàn)代人的遷徙與演化歷史提供了重要的遺傳學(xué)證據(jù)。”付巧妹說。

這也是科學(xué)家第一次針對我國南北方人群開展的時間跨度最大的系統(tǒng)性古基因組研究。

結(jié)果發(fā)現(xiàn),在沿著黃河流域直到西伯利亞東部草原的人群里,至少從9500年前起,他們就攜帶一種以新石器時代山東為代表的古北方人群成分,而中國大陸沿海及臺灣海峽島嶼人群,至少從8400年前起,就攜帶一種以新石器時代福建及其毗鄰島嶼為代表的古南方人群成分,而且這兩種成分截然不同。

這意味著,早在9500年前,我國的南北方人群就已經(jīng)分化了。

當(dāng)然,隨著時間的推移,南北方人之間的差異性和分化程度,又逐漸縮小了。付巧妹說,這種變化暗示著,自新石器時代以來,南北方人之間已經(jīng)有了頻繁的遷移與混合。至少在8000年前,南北人群融合與文化交流的進程即已開始,4800年前出現(xiàn)強化趨勢,至今仍在延續(xù)。

有意思的是,在這個過程中,古北方人群成分對現(xiàn)在的東亞人顯示出更多的影響。付巧妹說,在新石器時代之后,可以非常明顯地看到古北方人對整個中國南北方人群的影響。

有關(guān)東亞與東南亞祖先人群,學(xué)術(shù)界有一個“兩層假說”,即距今5000年及以前,中國福建奇和洞人與臺灣海峽亮島人等古南方人群,屬于“第一層”人群,他們與從事農(nóng)業(yè)經(jīng)濟的“第二層”農(nóng)業(yè)人群,也就是現(xiàn)代東亞人,是截然不同的。

不過,付巧妹團隊通過這次古DNA研究卻發(fā)現(xiàn),在至少8400年前,組成現(xiàn)今東亞人群、南島語系人群基因結(jié)構(gòu)的主要祖先群體之一,已經(jīng)在東南沿海出現(xiàn)。

“這表明,最早的南島語系人群,起源于與我國南方的福建及其毗鄰地區(qū)相關(guān)人群,并且這一時間可以明確追溯到8400年前。”付巧妹說。

這也是科學(xué)家第一次通過古基因組數(shù)據(jù),明確了中國8000多年前的古南方人群是南島語系人群的祖先來源。

沒有外來人群的“大換血”

另一個有意思的發(fā)現(xiàn)是,我國南北方人的這種演化互動,和歐洲人群截然不同。

在約9000年前農(nóng)業(yè)出現(xiàn)以來,歐洲人群就不斷遭遇近東遷徙而來的農(nóng)業(yè)人群,以及歐亞草原人群等外來群體的“大換血”。換言之,外來人群長期在重構(gòu)歐洲人群遺傳信息,對現(xiàn)今歐洲人產(chǎn)生重要影響。

我國的情況卻有所不同。根據(jù)這次研究可以看到,雖然早在9500年前,我國南北方人群已經(jīng)分化,但南北方同期人群的演化,基本是連續(xù)的。

“這說明我們沒有受到明顯的外來人群影響,遷徙互動,也主要發(fā)生在東亞區(qū)域內(nèi)各人群間。”付巧妹說。據(jù)她推斷,這可能與我國是稻作和粟作農(nóng)業(yè)的獨立起源中心有關(guān),不需要外來人群帶來農(nóng)業(yè),就能夠較好地自給自足。

如今,取得這一突破,付巧妹認(rèn)為一個關(guān)鍵的原因,還是在于古DNA技術(shù)的創(chuàng)新。

在科研團隊借助這一技術(shù)成功獲取相關(guān)基因組數(shù)據(jù)后,審稿專家給出高度評價:“研究提供了非常珍貴的基因組數(shù)據(jù),其代表的時間和區(qū)域,是前所未有而又必不可少的。”

在5月14日中科院和國家文物局聯(lián)合舉行的重大科學(xué)發(fā)現(xiàn)與研究成果發(fā)布會上,中科院院長白春禮院士專門向這一研究成果致賀信,其中談到他的評價:這項成果對于“探索中國史前人群的遷徙歷史、遺傳格局及內(nèi)部融合過程,對于明確現(xiàn)今主要生活在中國臺灣及太平洋島嶼等地的南島語系人群的祖先來源,具有重大的科學(xué)價值和社會意義”。

在接受記者采訪時,付巧妹說,這一發(fā)現(xiàn)填補了東方尤其是中國史前人類遺傳、演化、適應(yīng)方面的重要信息。她也坦言,該研究只是揭開人類演化史的冰山一角,同時提出更多、更深層的追問——

舊石器時代,中國南北方人群有著怎樣的互動與交流?新石器時代,北方沿海人群與內(nèi)陸人群是否存在較大差異?中國南北方人群的遷移,與農(nóng)業(yè)技術(shù)的傳播與擴散有何關(guān)聯(lián)?

付巧妹希望利用古DNA技術(shù),未來能一一破解這些謎團,“期待著新一輪中國史前人群研究帶來新的解答。”(記者 邱晨輝)

  • 標(biāo)簽:古DNA技術(shù),人群遷徙,南北方

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