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《自然》雜志發(fā)表基因組聚集數(shù)據(jù)庫(gnomAD)系列論文

新華網(wǎng) | 2020-05-29 10:10:10

英國《自然》雜志及其子刊27日在線發(fā)表了基因組聚集數(shù)據(jù)庫(gnomAD)團(tuán)隊(duì)的系列研究論文,介紹了研究人員對(duì)這個(gè)大型數(shù)據(jù)庫的多方面分析,其結(jié)果有助人們深入認(rèn)識(shí)人類基因功能,提升對(duì)罕見和常見遺傳病的理解。

基因組聚集數(shù)據(jù)庫(gnomAD)是一個(gè)大規(guī)模的人類遺傳變異體數(shù)據(jù)庫,匯集了來自不同人群的外顯子組數(shù)據(jù)和全基因組數(shù)據(jù),全球多國研究人員參與分析。研究人員將最新的分析結(jié)果匯集在7篇論文中,分別發(fā)表在《自然》《自然·通訊》及《自然·醫(yī)學(xué)》上。

研究人員在《自然》發(fā)表的一篇概述性論文中介紹,他們從125748個(gè)外顯子組和15708個(gè)全基因組測序數(shù)據(jù)中鑒定出了443769個(gè)預(yù)測的功能喪失型變異體。

同在《自然》上發(fā)表的其他論文還介紹了利用該數(shù)據(jù)庫創(chuàng)建的結(jié)構(gòu)變異資源庫,可用于評(píng)估基因缺失、復(fù)制甚至是顛倒方向等所產(chǎn)生的影響。

一些論文還探討了如何利用相關(guān)變異體評(píng)價(jià)候選藥物靶點(diǎn),提升對(duì)遺傳變異體的臨床解讀等。例如,《自然·醫(yī)學(xué)》上發(fā)表的一篇論文分析了與帕金森病風(fēng)險(xiǎn)增加相關(guān)的一個(gè)基因的變異體,結(jié)果顯示靶向這個(gè)基因可能是一種安全的治療方法。

美國布羅德研究所的丹尼爾·麥克阿瑟是gnomAD的領(lǐng)銜科學(xué)家。他在一份聲明中說,這些研究代表了這個(gè)項(xiàng)目的首批重要成果,這個(gè)數(shù)據(jù)庫的優(yōu)勢在于它的樣本規(guī)模以及采集人群的多樣性,這要感謝來自全球多地研究人員的貢獻(xiàn)。每一篇新發(fā)表的論文都代表了研究人員從一個(gè)新角度去分析這些數(shù)據(jù),從而為學(xué)界帶來新的科研資源。

盡管gnomAD數(shù)據(jù)庫取得了階段性成果,但研究人員指出,他們距離鑒定出人類全部的預(yù)測功能喪失型變異體還有很長的路要走。

  • 標(biāo)簽:基因組,數(shù)據(jù)庫,自然

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