浙江大學(xué)徐建明教授團(tuán)隊(duì)通過(guò)分析地球微生物組計(jì)劃大數(shù)據(jù),構(gòu)建了全球微生物共存網(wǎng)絡(luò)。通過(guò)對(duì)微生物“社會(huì)關(guān)系”的分析,揭示了地球多種環(huán)境中,微生物組之間的互聯(lián)模式。
這項(xiàng)研究近日發(fā)表在微生物領(lǐng)域期刊《微生物組》,合作者還包括美國(guó)加州大學(xué)圣迭戈分校、美國(guó)太平洋西北國(guó)家實(shí)驗(yàn)室以及比利時(shí)魯汶大學(xué)。
單個(gè)微生物在數(shù)量眾多的群落中繁衍生息,不同微生物間存在著共生、寄生、捕食和競(jìng)爭(zhēng)等關(guān)系。微生物不僅僅是“分解者”,它們還能影響到溫室氣體、綠色生產(chǎn)、人體健康的方方面面,其群落組成和功能具有極高的復(fù)雜性。
“過(guò)去科研人員常常在微觀尺度挖掘其具體特性,但有時(shí)如同盲人摸象,只能看到局部。就像人類(lèi)社會(huì),光是知道一個(gè)人叫什么名字,無(wú)法了解人類(lèi)社會(huì)的全貌,要知道人與人之間的關(guān)系才能更好地描述。”徐建明說(shuō)。
浙大科研人員通過(guò)構(gòu)建微生物生態(tài)網(wǎng)絡(luò)算法,建立了一個(gè)“篩子”,篩出微生物之間的交互作用,采用了來(lái)自土壤、植物、動(dòng)物等14個(gè)環(huán)境中的23000多個(gè)樣本,構(gòu)建了全球微生物共存網(wǎng)絡(luò)。
“采用統(tǒng)一采樣、測(cè)序、分析的全球最大標(biāo)準(zhǔn)化環(huán)境微生物組數(shù)據(jù)庫(kù)的建立,為中外科學(xué)家研究確定了豐富的數(shù)據(jù)資源。”徐建明說(shuō)。
通過(guò)這張網(wǎng)絡(luò),研究人員們發(fā)現(xiàn),土壤微生物組與動(dòng)物表面、動(dòng)物腸道和淡水微生物組有密切關(guān)系,而植物、動(dòng)物體表的微生物是連接兩組微生物網(wǎng)絡(luò)的“橋梁”。
“通過(guò)這張網(wǎng)絡(luò),我們對(duì)微生物的關(guān)系看得更清,為進(jìn)一步理解運(yùn)行機(jī)制提供了前提。”徐建明說(shuō)。