近日,武漢市園林科學(xué)研究院和中科院武漢植物園攜手研發(fā)出破譯荷花遺傳密碼的蓮基因組數(shù)據(jù)庫(kù)。日前,該數(shù)據(jù)庫(kù)在國(guó)際知名學(xué)術(shù)期刊公布,供各國(guó)荷花研究人員免費(fèi)共享。
據(jù)介紹,水生植物蓮是地球上最早出現(xiàn)的開花植物之一。研究發(fā)現(xiàn),早在約1.4億年前蕨類植物和恐龍稱霸地球的時(shí)代,在北半球許多水域已有蓮的分布。
武漢市園林科學(xué)研究院具有悠久的荷花研究傳統(tǒng)與歷史,目前收集、栽培國(guó)內(nèi)300多個(gè)荷花品種,2018年以來(lái)還引進(jìn)栽培了美洲蓮、澳洲蓮,以及印度、泰國(guó)、越南等國(guó)的蓮品種。中科院武漢植物園在蓮屬植物的科研上全國(guó)領(lǐng)先,2013年完成了中國(guó)古代蓮的基因組測(cè)序和分析,繪制了基因組框架圖譜。
2019年12月,兩家單位的學(xué)者聯(lián)手打造的蓮基因組數(shù)據(jù)庫(kù)問(wèn)世。2020年9月,該數(shù)據(jù)庫(kù)取得國(guó)家版權(quán)局授予的計(jì)算機(jī)軟件著作權(quán)。2021年1月,該數(shù)據(jù)庫(kù)在國(guó)際知名學(xué)術(shù)期刊《Scientific Data》在線發(fā)表。中科院武漢植物園李會(huì)博士和武漢市園林科學(xué)研究院楊星宇博士為論文并列第一作者。目前,研究樣本的基因組相關(guān)數(shù)據(jù)已上傳至全球通用的NCBI數(shù)據(jù)平臺(tái),對(duì)全球?qū)W術(shù)用途公開。
楊星宇表示,該數(shù)據(jù)庫(kù)有助于蓮的群體遺傳學(xué)和分子育種的相關(guān)研究,以及全面了解蓮全基因組的遺傳變異特征。通過(guò)數(shù)據(jù)追溯了解蓮的栽培馴化歷史,以便培育高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)的新品種,同時(shí)提高育種技術(shù)水平和速度。從這個(gè)意義上講,該數(shù)據(jù)庫(kù)是一把破解荷花分子遺傳密碼的“金鑰匙”。