來自紐約大學阿布扎比分校基因組學和系統(tǒng)生物學中心的研究團隊，近日成功對 2000 多年前已經(jīng)滅絕的棗椰樹(Phoenix dactylifera L.)進行基因組測序。團隊從黎凡特南部地區(qū)的考古遺址中找到的棗椰樹種子進行了測序，這些種子的放射性碳化時間為公元前 4 世紀至公元 2 世紀。
這些種子經(jīng)過發(fā)芽，產(chǎn)生了可行的新植物。研究人員對這些發(fā)芽的古代樣本進行了全基因組測序，并利用這些基因組數(shù)據(jù)來研究這些以前已經(jīng)滅絕的猶太棗椰樹(Judean date palms)的遺傳學。這項研究標志著研究人員首次對古代發(fā)芽種子的植物基因組進行測序。
通過檢查幾個世紀前繁榮的物種(Phoenix dactylifera L.)的基因組，生物學教授 Michael D. Purugganan 和他紐約大學的同事，以及以色列和法國的研究伙伴，能夠看到這些植物在一段時間內(nèi)是如何進化的。
在這種情況下，他們觀察到，在公元前4世紀和公元2世紀之間，地中海東部的棗樹開始顯示出來自另一個物種--Phoenix theophrasti(目前生長在克里特島和一些希臘島嶼的棗椰樹)越來越多的基因。他們的結(jié)論是，在這一時期來自 P. theophrasti 的基因水平不斷提高，表明羅馬帝國在地中海東部的影響越來越大。
Purugganan 表示：“我們很幸運，棗樹種子可以活很久--在這種情況下，超過2000年--并且在該地區(qū)的干燥環(huán)境中以最小的DNA損傷發(fā)芽。通過復活生物材料，如來自考古、古生物遺址或歷史收藏品的發(fā)芽的古代種子，我們不僅可以研究失落種群的基因組，而且在某些情況下，還可以重新發(fā)現(xiàn)現(xiàn)代品種中可能已經(jīng)滅絕的基因”。
